Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms