Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms