Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBDO15205 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBDO15205 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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