Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms