Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms