Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009262.1-201ENST00000446484 510 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL096855.1-201ENST00000449895 516 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357037.1-201ENST00000454758 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FTLP15-201ENST00000455449 532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX18P4-201ENST00000456554 838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005237.1-201ENST00000458377 559 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN20-214ENST00000503851 545 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN20-220ENST00000508715 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00051-201ENST00000517704 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007552.1-201ENST00000540992 927 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC111152.2-201ENST00000561392 485 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL17A-206ENST00000622488 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SCIMP-203ENST00000574081 2383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC13-AS1-201ENST00000418161 2049 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A7A-201ENST00000329256 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP13-4-201ENST00000334068 797 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10Z1-201ENST00000361284 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RCL1-202ENST00000381730 801 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF267-202ENST00000394846 680 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM218BP-201ENST00000408897 458 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596223.2-201ENST00000413220 434 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM43CP-201ENST00000422468 1028 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC078777.1-201ENST00000425371 777 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms