Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CHPFQ8IZ52 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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