Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARHGEF6Q15052 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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