Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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