Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms