Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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