Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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