Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms