Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms