Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms