Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms