Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms