Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms