Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRHP20396 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRHP20396 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRHP20396 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRHP20396 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRHP20396 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms