Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms