Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms