Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TNS3Q68CZ2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNS3Q68CZ2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms