Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DCAF6Q58WW2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms