Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CCDC96Q2M329 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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