Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms