Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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