Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms