Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms