Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms