Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK17Q00537 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms