Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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