Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA3P42263 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA3P42263 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms