Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms