Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP2C9P11712 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms