Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN11O75508 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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