Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms