Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms