Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms