Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms