Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CATSPER4Q7RTX7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms