Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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