Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms