Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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