Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms