Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms