Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CNGB1Q14028 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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CNGB1Q14028 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CNGB1Q14028 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB1Q14028 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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