Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms