Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms