Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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STRN3Q13033 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRN3Q13033 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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