Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms